Сюжет крутится вокруг секретной японской шпионской организации «Агентство Д» созданной осенью 1937 года, возглавляемой полковником Юки, прозванным "Владыкой Тьмы". По слухам, Юки сам в прошлом был хорошим агентом и добыл у врага немало секретов, пока его не предал союзник. До побега из плена подполковника жестоко пытали, чем объясняется отсутствие левой руки и то, что он ходит с тростью, прихрамывая на левую ногу. Он самолично выбирал и тренировал людей, подходящих для шпионских миссий по всему миру. Юки учит солдат по принципам, которые сильно отличаются от традиционной армейской мудрости. Игнорируя армейские ранги, одежду и поведение, он учит своих подопечных быть незаметными и невидимыми, а также берёт кандидатов издалека, тренируя специалистов нескольким языкам, взлому и мастерству скрытности.